当在使用知网查重时发现引用格式不对，首先应该检查原文的引用格式是否正确。如果是因为原文引用格式错误导致查重格式不对，可以尝试修改原文的引用格式，然后重新进行查重。如果确定原文引用格式无误，但查重仍然显示格式错误，可以尝试联系知网客服寻求帮助，他们会提供进一步的解决方案。

另外，也可以尝试将原文中的引用部分逐一核对，确保每一处引用格式都符合要求。有时候查重系统可能会对引用格式要求较为严格，因此需要仔细核对每一处引用，确保格式的准确性。同时，也可以参考知网的使用手册或相关文档，查看是否有关于引用格式的具体要求和解决方案。